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自动化研究所人才库

  • 姓名: 陈曦
  • 性别: 男
  • 职称: 正高级工程师
  • 电子邮件: xi.chen@ia.ac.cn
    简  历:
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    研究领域        生物组织高通量序列图像实时配准技术        
    个人主页        http://www.mira.ia.ac.cn/product/16.html        

     

    简历        
    教育经历

    2000
    - 2004年,西安交通大学,学士
    2004
    - 2009年,众博在线注册登录,工学博士

    工作经历:

    2021-04~现在, 众博在线注册登录, 研究员

    2012-10~2021-04,众博在线注册登录, 高级工程师

    2009-07~2012-10,众博在线注册登录, 助理研究员               
                                                     
    学术成就        
    发表论文
    1. Virus Identification in Electron Microscopy Images by Residual Mixed Attention Network, Computer Methods and Programs in Biomedicine, 2021,
    2 作者

    2. Human Attention-inspired Volume Reconstruction Method on Serial Section Electron Microscopy Images, Cytometry: Part A, 2021, 通讯作者

    3. Dual Networks for High-Precision and High-Speed Registration of Brain Electron Microscopy Images, Brain Sciences, 2020, 通讯作者

    4. SiamBOMB: A Real-time AI-based System for Home-cage Animal Tracking, Segmentation and Behavioral Analysis, IJCAI, 2020, 1 作者

    5. A common hub for sleep and motor control in the substantia nigra, Science, 2020, 8 作者

    6. Robust Global Optimized Affine Registration Method for Microscopic Images of Biological Tissue, International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing(ICASSP), 2020, 通讯作者

    7. Skeleton-based image registration of serial electron microscopy sections, SPIE Medical Imaging, 2019, 1 作者

    8. Image deformation based on contour using moving integral least squares, IET Image Processing, 2019, 通讯作者

    9. Fully Deep Convolutional Neural Networks for Mitochondria Segmentation, SPIE Medical Imaging, 2018, 3 作者

    10. An unsupervised network for fast microscopic image registration, SPIE Medical Imaging, 2018, 通讯作者

    11. Correlative light and electron microscopy for complex cellular structures on PDMS substrates with coded micro-patterns, Lab on a Chip, 2018, 通讯作者

    12. Non-iterative simulations rigid registration method for serial sections of biological tissue, IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, 2018, 通讯作者

    13. Morphology-Retained Non-Linear Image Registration of Serial Electron Microscopy Sections, IEEE International Conference on Image Processing, 2018, 1 作者

    14. Deep Contextual Residual Network for Electron Microscopy Image Segmentation in Connectomics, IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, 2018, 3 作者

    15. A Refined Spatial Transformer Network, International Conference on Neural Information Processing, 2018, 通讯作者

     

    专利成果
    1.
    一种对扫描电子显微镜图像畸变进行校正的方法, 发明, 2015, 1 作者, 专利号: ZL201110014855.6

    2. 多幅显微图像拼接中的灰度校正方法及装置, 发明, 2018, 1 作者, 专利号: 201711287182.5

    3. 生物组织序列切片显微图像的配准方法及装置, 发明, 2020, 1 作者, 专利号: 201710638426.3

    4. 面向序列切片的扫描电镜图像实时配准装置及方法, 发明, 2020, 1 作者, 专利号: 201711248908.4

    5. 显微序列图像拼接方法及装置, 发明, 2019, 1 作者, 专利号: 201811213303.6

    6. 生物样品三维结构的构建方法及装置, 发明, 2021, 1 作者, 专利号: 201811213305.5

    7. 大视场光学显微图像成像装置及方法, 发明, 2020, 1 作者, 专利号: 201811213274.3

    8. 基于X光图像的生物组织电镜图像校正方法、系统和装置, 发明, 2021, 1 作者, 专利号: 202011372160.0


                                     
    在研课题        

    1. 序列切片透射电镜电子断层成像数据配准系统研制, 主持, 部委级, 2020-09--2022-08

    2. 笼养动物实时跟踪、分割和行为分析的智能化系统, 主持, 部委级, 2020-01--2024-12

    3. 中科院关键技术人才, 主持, 部委级, 2019-01--2021-12

     

    社会任职:
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    研究方向:
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    承担科研项目情况:
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    代表论著:
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    获奖及荣誉:
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